英国投票脱离欧盟给制药公司监管带来许多不确定因素，总部位于伦敦的欧洲药品管理局（EMA），这个批准所有欧盟国家药物的机构预计将进行搬迁。 德国制药工业协会 24 日表示，欧洲药品管理局这个相当于美国食品和药物管理局的机构将需要搬迁到欧盟范围内的城市，同时也为企业管理带来了挑战。
英国最大的制药商葛兰素史克公司表示，投票脱欧「给我们的未来发展带来了不确定性和潜在的复杂性」，尽管这对其全球业务的影响会很小，但英国制药行业协会警告称，未来的投资，研究和就业充满挑战。企业高管担心脱欧可能扰乱 EMA 现在的欧盟药品审批程序，而英国可能会开发自己国内的监管体系，进一步出现混乱。
虽然英国可以像挪威一样继续留在欧洲经济区，而保留 EMA 评审系统，但许多支持脱欧的人反对这项选择。其结果是，英国的患者获得新药的机会就可能滞后，因为企业会倾向更大的欧盟市场，并且一些药品可能因为不在监管范围而无法获取。
EMA 总部设在伦敦金丝雀码头的全球银行之中，拥有超过 600 名全职员工，是英国最大的欧盟机构。该机构自 1995 年以来一直负责整个欧洲的药品审批。 一位 EMA 发言人称对未来发表评论是不成熟。「在这个阶段预见脱欧决定带来的影响还为时尚早，我们正在等待欧盟委员会的进一步指导，」她表示。
瑞典，丹麦，意大利和德国的制药公司和医药部门官员都表示希望 EMA 将总部从伦敦搬迁至本国，因为这些国家的企业都希望尽可能的接近主要监管机构。
英国脱欧造成的出口利润影响将是有限的，因为迄今为止美国对于许多全球药品制造商来说仍然是最大的处方药市场，而亚洲市场的重要性也日益增强。葛兰素史克公司表示，预计不会对其业务产生实质性的影响，分析师预计由于海外收入转换为英镑，短期内受到英镑走低的影响该公司会享受到盈利的推动作用。
以美元报告业绩的阿斯利康，以及瑞士竞争对手罗氏将享受不到这种货币因素的收益，但都表示在全民公决之后会继续支持英国生命科学行业，并且这是至关重要的。 英国制药行业的员工人数超过 70000 人，制药业占该国所有企业研发支出的 25%。
许多科学家担心，近几十年来得到欧盟很好支持的用于学术研究的资金现在将有所减少，同样受影响的还有英国欧洲之间重要的研究合作。罗伯特莱克勒医学科学院院长表示，「既然已经确定离开欧盟，对于政府来说制定明确的计划以保障英国科学和研究的未来是至关重要的。」
