一项综合的安全性分析显示，托法替尼用于类风湿关节炎(RA)的严重不良事件随着时间的推移仍保持稳定，发生率并未在长期用药患者中出现升高。例如，在接受托法替尼治疗长达6个月的患者中，严重感染发生率（最常见严重不良事件）为2.57/100病人年，在口服这款Janus激酶抑制剂超过42个月的患者中，严重感染发生率为1.89/100病人年。
“在类风湿关节炎临床试验中，严重不良事件比较典型，大多数严重感染是肺炎，”他在欧洲风湿病防治联合会年会上说道。这项分析包括来自6项2期临床试验、6项3期临床试验及两项正在进行的长期扩展性研究中的5671名患者，这些患者对常规治疗或生物治疗药物已经无法产生反应。
自2013年4月截止日期，已有12664病人年的药物使用。平均用药时间是2.4年，但有555人有4年多的时间一直在使用托法替尼。
16.3%的患者因不良事件中止治疗。带状疱疹的总发生率是4.22/100病人年，用药长达6个月时，带状疱疹的发生率是4.20/100病人年，用药超过42个月时，带状疱疹的发生率是2.11/100病人年。大多数带状疱疹病例(93%)不严重，很少有患者出现浸染或多皮区带状疱疹。
其它严重感染也有较低的发生率，机会感染的发生率为0.25/100病人年，肺结核的发生率为0.21/100病人年，但在美国的发生率更低，为0.02/100病人年26名出现结核病的患者中，15名患者是肺结核，并且有2名患者在基线筛查时呈阳性，Curtis表示说。
恶性疾病（包括非黑色素瘤性皮肤癌）的发生率也较低，为0.85/100病人年。对于那些用药不超过6个月的患者，恶性疾病发生率为0.70/100病人年，而用药超过42个月的患者，恶性疾病发生率为1.04/100病人年。
淋巴瘤和淋巴组织增生性疾病总发生率为0.06/100病人年，用药不超过6个月和用药超过42个月的患者中，淋巴瘤和淋巴组织增生性疾病发生率分别为0.04/100病人年和0.12/100病人年。
主要心血管不良事件发生率为0.46//100病人年，有一位病例死于阑尾炎。在托法替尼的较长期使用中未出现新的不良事件信号。
